Também são encontrados fungos (cogumelos) bioluminescentes, entretanto, poucos estudos sobre o assuntos foram realizados e pouco se sabe a respeito. O que se sabe é que é um sistema completamente diferente e surgiu independentemente do sistema dos insetos.
O reino dos fungos, com mais de um milhão e meio de espécies, algumas delas microscópicas, é ainda quase desconhecido pela ciência. Apesar do pouco conhecimento que se tem sobre os fungos, reconhece-se que entre eles há muitos que já se tornaram imprescindíveis para a saúde humana, uma vez que comtribuem de forma decisiva para a preservação da diversidade biológica do nosso planeta. Os fungos atuam em nossa vida de inúmeras maneiras. No pão, por exemplo, eles agem como fermento biológico. A rápida multiplicação do fungo produz minúsculas bolhas de gás carbônico, fazendo com que a massa cresça.
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